Manzarek è conosciuto principalmente per il suo lavoro con i Doors, che ha formato nel 1965 dopo un incontro su Venice Beach con il poeta Jim Morrison. I Doors hanno venduto più di 100 milioni di dischi in tutto il mondo, e hanno ricevuto 19 dischi d’oro, 14 di platino e 5 multi platino solo negli States.
Celeberrima l’intro a tastiera di “Light My Fire”, ma tra i successi più famosi della band ci sono“L.A.Woman”, “Break On Through to the Other Side”, “The End” e “Hello, I Love You”.
Dopo la morte di Morrison i Doors si sono presi una pausa fino al 2002: Manzarek e Robby Krieger hanno ridato vita alla formazione con diversi cantanti. Negli ultimi anni hanno lavorato persino con Skrillex.